Virus H1N1: un supercomputer GPU per simulare il virus

Dei ricercatori dell’Institute of Process Engineering of Chinese Academy of Sciences sono riusciti per la prima volta a simulare il virus H1N1, responsabile della pandemia influenzale degli ultimi anni. Come hanno fatto? Semplice, utilizzando un super sistema mole-8.5 con applicazione di dinamica molecolare. Il tutto per guardare in maniere approfondita la struttura atomica del virus.

“Il supercomputer Mole-8.5 ci permette di compiere attività di ricerca scientifica che semplicemente prima non erano possibili. Questa ricerca è un passo importante nello sviluppo di percorsi più efficaci per controllare le epidemie e per creare medicine antivirali” ha commentato Ying Ren, assistente professore presso il CAS-IPE. Lo studio di virus o batteri durante gli esperimenti di laboratorio sono lavori molto complessi dato che le reazioni che avvengono sono molto veloci e quindi difficili da controllare.

Il software di dinamica molecolare sviluppato dagli scienziati del CAS-IPE utilizza l’accelerazione GPU e il supercomputer mole-8.5 utilizza 288 nodi con 2200 GPU NVIDIA Tesla. I ricercatori hanno così simulato 770 picosecondi al giorno, con un tempo di integrazione di 1 femtosecondo per 300 milioni di atomi o radicali.

Via Newelectronics.co.uk